Nombre a la capa superior "Line Art"
Nombre la capa del medio "Color"

Borra la capa de Fondo rellenandola de blanco.

Pulsa en la capa "Line Art" para activarla ( la capa activa esta indicada por el pequeño pincel que aparece a la izquierda de la ventanita de preview).

De la barra de menu superior elije "Seleccionar>>Cargar Seleccion". Te aparecera un menu "pop-up" con un menu desplegable de seleccion. Elige "ALPHA 1" y pulsa OK.

Ahora veras una especie de caminito de hormigas que es la seleccion de tu Dibujo de Linea (LineArt).

Ahora tienes una capa flotante de tu Dibujo. Esto esta bien porque ahora solo hay negro en el canal del Dibujo Lineado y puedes ver a traves de la capa de Fondo. Esta preparacion nos permitira colear en la capa inferior sin deformar el dibujo en la capa superior.

Fijate siempre cual es la capa "Activa".