Pon la capa uno a "Preservar Transparencia" marcando la "checkbox" en el menu de capas, como se muestra justo arriba. Esto te permite pintar por encima de las lineas existentes sin que sean pintadas y echarlas a perder. Es una caracteristica muy util. :) Selecciona un pincel grande y pinta sobre todo el dibujo con color puramente negro. Las lineas del dibujo deberían volver a su oscuro anterior.